广东省微生物研究所自建所以来，始终针对广东省和华南地区经济社会发展的迫切需求，围绕“微生物资源研究以及有益微生物的利用和有害微生物的控制”的核心科学问题，持续开展应用基础理论研究与行业关键技术研发，在微生物资源多样性与前期开发、微生物生态与环境污染控制、微生物危害及其检测与控制、微生物分子育种及生物转化、食药用菌生物技术等研究领域获得了有影响力的成果，为解决本地区与微生物专业相关的食品安全、环境保护和工、农业生物技术等行业的关键性共性技术问题做出了突出的贡献，支撑了相关行业和企业的发展和技术升级。

      1978年以来，在科技成果方面，共取得科技鉴定成果176项，其中国际先进、领先水平的67项；获得国家及省部级成果奖101项，其中国家级成果奖6项、省部级一等奖12项；在专利申请方面，共申请专利287件，其中发明专利275件，授权专利162件，其中发明专利150件。在国内外核心学术刊物发表论文1700多篇，出版科技专著35部。特别是2010年以来，研究所在国内外学术刊物发表科研论文461篇，其中SCI和EI收录共152篇，其中我所研究员许玫英以共同第一作者身份在影响因子（IF）为17.949的国际学术期刊上《Ecology Letter》发表的学术论文，在同行引起广泛关注；申请专利122件，其中申请发明专利117件，实用新型5件；授权专利86件，其中授权发明专利81件。

       重大科技成果：

       一、“杀虫杆菌-杀螟杆菌”在1978年获得全国科学技术大会奖，该成果在华南和中南1亿多亩的水稻田推广使用，取得了巨大的社会和经济效益；

       二、“短裙竹荪室内栽培技术”在1983年获得国家发明三等奖，该成果的应用使短裙竹荪这种昂贵的食用菌迅速进入了千家万户的餐桌；

       三、“采用高产苷技术生产肌苷”在1997年获得国家科技进步三等奖，目前使用该成果生产的肌苷依然占据全国肌苷总产量的80%以上；

       四、2007年“含氨氮和多环芳烃类毒害性废水的微生物处理新技术”获国家环保总局科技进步一等奖，这是迄今为止唯一一家省属科研单位获得的国家环保一等奖，该成果攻克了重油制气和垃圾渗滤液处理等行业性的难关，为广州创建文明城市、环保城市、卫生城市发挥了巨大作用；

       五、“食用菌优质高效大规模生产关键技术研究”获2007年度国家科技进步二等奖，该成果是食用菌行业近20年来首次获得国家级奖励，为食用菌产业从传统作坊式生产向现代农业的工厂化、产业化生产升级换代提供了系列技术；

       六、2010年“食品微生物安全快速检测与高效控制技术”获国家科技进步二等奖，该成果在微生物快速检测与高效控制方面取得了新的突破，为食品微生物安全提供了有力的技术保障；

       七、2013年“瓶装饮用水溴酸盐控制方法”获广东省专利金奖及第十五届中国专利优秀奖，该成果为解决我国包装饮用水安全提供了强有力的技术支撑；

       在研究所传统优势学科—大型真菌分类方面，实验室先后获得了4项省部级一等奖，6项省部级二等奖，特别是2008年的“中国华南及邻区森林大型真菌多样性研究及其应用”获得广东省科学技术一等奖，该成果依据生物学的系统分类学、生态学和资源学原理和方法，阐明了华南及邻区森林大型真菌种类、形态特征、种类组成及分布特点；采集标本近6万号，描述华南及邻区森林大型真菌2纲26目63科290属2360余种；发现新物种165个、新组合106种、新记录种736个；收集菌株2000株，驯化食用菌16种；创建了系统可行的经济真菌资源调查研究与开发利用平台；为真菌资源储备和研究提供了丰富的数据和创新材料；是我国近十年来生物资源本底调查的一项重大成果。