研究团队

微生物与动物代谢研究组

中心主任
 
 崔宗斌研究员
团队简介
       微生物与动物代谢研究组(简称“代谢组”)是在广东省科学院 “百人计划”引进专项(2021GDASYL-20210102003)资助下,依托广东省科学院微生物研究所和华南应用微生物国家重点实验室组建的创新研究团队,重点以模式动物和经济鱼类为研究对象,解析肠道微生物及其代谢产物对营养物质的消化吸收、体内物质和能量代谢、免疫调节和疾病发生等的作用和分子调控机制,筛选抗病、抗逆、抗应激等分子靶标和创制重要经济鱼类的抗病、抗逆等新品种,建设国内一流、国际先进水平的 “微生物功能和药物研发的SPF模式动物创新平台”。这些内容是崔宗斌研究员自2006年起在中科院水生生物研究所开展工作和研究的延续和拓展。 
      崔宗斌研究员长期从事动物遗传和发育的基础和应用基础研究,在解析鱼类发育、生长、代谢、抗逆重要信号通路的活性调控机制以及新型生物反应器研制等方面,取得了系列研究成果,获中科院自然科学一等奖1项,国家自然科学三等奖1项,中科院青年科学家奖和院长特别奖,国际专利1项,国内发明专利5项。已在Genetics、Molecular and Cellular Biology、Journal of Biological Chemistry、Hepatology等国际和国内重要学术刊物发表学术论文80余篇,其中SCI论文50余篇。2006年至今,主持国家科技部863课题1个,国家科技部973课题1个,国家重点研发计划课题1个,国家自然科学基金委项目5项,广东省重点研发计划项目1项,国家自然科学基金水产学科迄今唯一的创新研究群体任务1项,中科院鱼类分子模块育种先导A任务1项,其它科研项目20余项。
研究领域
     1.微生物与水产动物营养、代谢和健康调控研究。 重点围绕鱼体健康、水体健康和经济鱼类新品种创制,开展如下研究:构建华南地区重要水产动物肠道微生物数据库,挖掘一批改善肠道微生态的微生物;探究微生物及其代谢产物对水产动物营养物质消化吸收、体内物质和能量代谢、免疫调节和疾病发生等的作用和分子机制;开发靶向肠道菌群及其代谢产物的绿色健康菌剂、多功能发酵饲料和饲料添加剂;针对重要经济鱼类的病毒病、细菌病、不耐缺氧、不耐低温、应激性强等问题,筛选和利用已有分子靶标,采用最新的基因编辑、分子模块等育种技术,创制重要经济鱼类的抗病、抗逆等新品种。 
      2.基于鱼类新型生物反应器的微生物活性物质高效表达与应用: 微生物来源珍稀生物活性物质鉴定和功能研究;鱼类粘液腺高效生物反应器研制;鱼类粘液腺分泌机制和分泌效率提升研究;粘液腺表达生物活性物质的分离与应用开发。
组织结构
持续建设中……
人员构成
      创新研究团队现有14人,其中包括研究员2人,副高级2人,助理研究员2人,博士后和研究生8人。
      今后五年期间计划引进高层次(研究员)科研人员1-2人,中青年科研人员4-5人,培养博士后研究人员10人,培养研究生10-20人。
研究成果
一、近期发表主要论文(*通讯作者): 
1. Tong Zhou, Bolan Zhou, Yasong Zhao, Qing Li, Guili Song, Zuoyan Zhu, Yong Long, Zongbin Cui*, 2021. Development of a Mucus Gland Bioreactor in Loach Paramisgurnus dabryanus. International Journal of Molecular Sciences, 22:687. 
2. Jing Ren, Yong Long, Ran Liu, Guili Song, Qing Li, Zongbin Cui*, 2021. Characterization of biological pathways regulating acute cold resistance of Zebrafish. International Journal of Molecular Sciences, 22:3028. 
3. Yong Long#; Xixi Li#, Fengyang Li, Guodong Ge, Ran Liu, Guili Song, Qing Li, Zhigang Qiao, Zongbin Cui*, 2020. Transcriptional programs underlying cold acclimation of common carp (Cyprinus carpio L.). Frontiers in Genetics, 11:556418. 
4. Junjun Yan, Yong Long, Tong Zhou, Jing Ren, Qing Li, Guili Song, Zongbin Cui*, 2020. Dynamic phosphoproteome profiling of zebrafish embryonic fibroblasts during cold acclimation. Proteomics, 20:1900257. 
5. Guodong Ge, Yong Long*, Lianyu Shi, Jing Ren, Junjun Yan, Chitao Li, Qing Li, Zongbin Cui*, 2020. Transcriptomic profiling revealed key signaling pathways for cold tolerance and acclimation of two carp species. BMC Genomics, 21: 539. 
6. Fangfang Shen#, Yong Long#, Fengyang Li, Guodong Ge, Guili Song, Qing Li, Zhigang Qiao, Zongbin Cui*, 2020. De novo transcriptome assembly and sex-biased gene expression in the gonads of Amur catfish (Silurus asotus). Genomics, 112(3): 2603-2614. 
7. Kai Chen, Xixi Li, Guili Song, Tong Zhou, Qing Li, Yong Long, Zongbin Cui*, 2019. Deficiency in the membrane protein Tmbim3a/Grinaa initiates cold-induced ER stress and cell death by activating an intrinsic apoptotic pathway in zebrafish. Journal of Biological Chemistry, 294:11445-11457. 
8. Xiaojie Yang, Xixi Li, Qilin Gu, Qing Li, Zongbin Cui *, 2019. Nucleoporin 62-like protein is required for the development of pharyngeal arches through regulation of Wnt/beta-catenin signaling and apoptotic homeostasis in zebrafish. Cells, 8:1036. 
9. Tianbing Chen, Guli Song, Huihui Yang, Lin Mao, Zongbin Cui*, Kaiyao Huang*, 2018. Development of the swimbladder surfactant system and biogenesis of lysosome-related organelles is regulated by BLOS1 in zebrafish. Genetics, 293(3):1131-1146.  
10. Yi Zhao, Guili Song, Jing Ren, Qing Li, Shan Zhong*, Zongbin Cui*, 2018. Sleeping Beauty transposon-mediated Poly(A)-trapping and insertion mutagenesis in mouse embryonic stem cells. Environmental and Molecular Mutagenesis, 59:687-697. 
11. Xiaohui Li, Guili Song, Yasong Zhao, Feng Zhao, Chunyan Liu, Dong Liu*, Qing Li*, Zongbin Cui*, 2017. Claudin7b is required for the formation and function of inner ear in zebrafish. Journal of Cellular Physiology, 233(4):3195-3206. 
12. Zhouquan Li, Yong Long, Liqiao Zhong, Guili Song, Xiaohua Zhang, Li Yuan, Zongbin Cui* and Heping Dai*, 2016. RNA sequencing provides insights into the toxicogenomic response of ZF4 cells to methyl methanesulfonate. Journal of Applied Toxicology, 36(1): 94-104. 
13. Xiaojie Yang,Qilin Gu,Li Lin,Shaoyang Li,Shan Zhong,Qing Li,Zongbin Cui*,2015. Nucleoporin 62-like protein activates canonical Wnt signaling through facilitating the nuclear import of β-catenin in zebrafish. Molecular and Cellular Biology, 35(7):1110-1124. 
14. Guohui Feng, Yong Long, Jinrong Peng, Qing Li*, Zongbin Cui*, 2015. Transcriptomic characterization of the dorsal lobes after hepatectomy of the ventral lobe in zebrafish. BMC Genomics, 16:979. 
15. Yong Long, Junjun Yan, Guili Song, Xiaohui Li, Xixi Li, Qing Li*, Zongbin Cui*. 2015. Transcriptional events co-regulated by hypoxia and cold stresses in zebrafish larvae. BMC Genomics, 16:385. 
16. Qilin Gu, Xiaojie Yang, Li Lin, Shaoyang Li, Qing Li, Shan Zhong, Jinrong Peng, Zongbin Cui*, 2014. Genetic ablation of solute carrier family 7a3a leads to hepatic steatosis in zebrafish during fasting. Hepatology, 60:1929-1941. 
二、近期申报主要专利: 
1. 崔宗斌 等, 2019。一种鱼类皮肤粘液腺生物反应器的制备方法及应用。中国发明专利申请号:CN201910912452.X 
2. Cui et al., 2020. Method for preparing fish skin mucous gland bioreactor and application thereof. USA Patent(#16/905.930)
荣誉奖励
1. 鱼类基因转移育种应用基础研究, 三等奖, 国家级, 1997 
2. 鱼类基因转移育种应用基础研究, 一等奖, 部委级, 1996 
3. 中科院青年科学家奖, 二等奖, 1997 
4. 中科院院长奖,特别奖, 1997
承担项目
1. 科技部重点研发计划课题,崔宗斌主持,522万元,2019.09 - 2024.08 
2. 广东省科学院“百人计划”引进专项,崔宗斌主持,530万元, 2021.01 - 2025.12 
3. 广东省重点领域研发计划项目,崔宗斌主持,1000万元,2020.10 - 2023.10 
4. 国家自然科学基金委创新群体(任务),崔宗斌承担,180万元,2018.01 - 2023.12 
5. 国家自然科学基金面上项目,崔宗斌主持,59万元,2019.01 - 2022.12
研究生教育
       崔宗斌研究员于2006年获中科院研究生院研究生指导教师证和教育部高等教育教师资格证。2007年至2019年,在中科院武汉分院研究生授课“分子细胞生物学---细胞内的信号传导”;2018年,在中国科学院大学怀柔校区研究生授课“水产生物发育生物学”。 
已培养研究生和博士后: 
龙 勇,博士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
商汉桥,博士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
厉 洁,博士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
宋桂丽,博士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
李媛媛,博士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
何小镇,博士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
辜麒麟,博士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
冯国辉,博士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
刘春艳,博士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
杨小杰,博士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
周波兰,博士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
李晓晖,博士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
陈 凯,博士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
严军军,博士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
李西西,博士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
葛国栋,博士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
任 静,博士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
周 同,博士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
王 璐,硕士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
毛 琳,硕士研究生,生物工程,中科院水生生物研究所
陈艺元,硕士研究生,生物工程,中科院水生生物研究所 
莫赛军,博士后,遗传学,中科院水生生物研究所 
陆 星,博士研究生,遗传学,武汉大学 
张 浪,博士研究生,遗传学,武汉大学 
林 立,硕士研究生,生物工程,武汉大学 
李凤阳,硕士研究生,生物化学与分子生物学,大连海洋大学 
在读研究生和在站博士后: 
赵雅颂  博士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
刘仁燕  硕士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
刘 冉   硕士研究生,生物化学与分子生物学,大连海洋大学 
谢巨洪  硕士研究生,遗传学,中科院水生生物研究所 
胡 寒   硕士研究生,遗传学,西南大学 
李西西  博士后,广东省科学院微生物研究所 
葛国栋  博士后,广东省科学院微生物研究所 
任 静  博士后,广东省科学院微生物研究所